Amaçlar:
Su kaynaklarının etkin ve sürdürülebilir kullanımı doğrultusunda, sucul ortamları, su ürünlerini ve sucul canlıların biyolojisini bilen, bu alandaki sorunlara bilimsel ve teknik çözümler üretebilen mühendisler yetiştirmek amaçlanmaktadır. Aynı zamanda, su ürünleri üretimi, yetiştiriciliği, avcılığı, işlenmesi ve pazarlanması konularında uygulamalı bilgiye sahip, çevre ve ekosistem bilinci gelişmiş bireyler yetiştirmek temel hedeflerdendir. AR-GE faaliyetleriyle sektöre katkı sağlamak, sucul kaynakların korunması, iklim değişikliğinin denizel ve içsu ekosistemlerine etkilerini izlemek ve bu bilgileri hem öğrencilere hem de sektöre aktarmak önemli bir misyon olarak benimsenmiştir. Eğitim-öğretim sürecinde ise alanında yetkin akademik kadro ile toplum ve çevreye duyarlı, etik değerlere sahip mühendisler yetiştirmek hedeflenmektedir.

Hedefler:
Denizel ve içsu ekosistemlerinin yapısını, işleyişini ve bu sistemlerdeki canlıların biyolojik özelliklerini dikkate alarak doğal kaynakların sürdürülebilir kullanımını sağlamak; avcılık, yetiştiricilik ve işleme gibi sektör alanlarında modern teknolojilerin uygulanmasını teşvik etmek; çevre dostu üretim modelleriyle kalite ve verimliliği artırmak hedeflenmektedir. Ayrıca, su ürünleri sektörünün gelişimine katkı sunacak şekilde mesleki bilgi üretebilen, bilimsel gelişmeleri takip eden, disiplinler arası çalışmalarda yer alabilen, çevresel sorunlara duyarlı, çözüm odaklı düşünebilen, girişimci ve nitelikli su ürünleri mühendisleri yetiştirilmesi amaçlanmaktadır.